虚拟突变（virtual mutation），理学-生物学-生物工程-蛋白质工程-蛋白质工程-蛋白质分子设计-蛋白质理性设计，利用计算方法对氨基酸或基因进行突变，用于预测或设计蛋白质功能的技术。又称模拟突变或计算突变（computational mutagenesis）。蛋白质中氨基酸的改变有可能导致蛋白质物理化学性质、结构与功能等一系列变化。蛋白质氨基酸定点突变是研究蛋白质结构和功能，改善蛋白质的生物学和物理化学性质的有力工具。利用计算机对蛋白质的序列进行虚拟突变和筛选，能够克服定点突变和定向进化实验所带来费时、费力和昂贵的缺点。