合肥工业大学研究生教育始于1960年，1978年恢复招生，1986年招收博士研究生。经过二十多年的发展，形成了能够培养层次完整，类型多样的研究生培养体系。与美国俄亥俄州立大学、乔治.梅森大学、德国斯图加特大学、汉诺威大学、澳大利亚迪肯大学等30多所世界知名大学建立了友好合作关系。学校设有博士后科研流动站、"长江学者奖励计划"特聘教授岗位;8个博士后科研流动站，6个博士学位授权一级学科，25个博士学位授权点，83硕士学位授权点;具有建筑学硕士、工商管理硕士(MBA)、公共管理硕士(MPA)、工程硕士、高校教师在职攻读硕士学位等4种专业学位授予权，其中工程硕士专业学位授权领域已达23个，目前在校研