代谢途径/网络重构（metabolic pathwaynetwork reconstruction），理学-生物学-生物工程-发酵工程-发酵史-代谢工程-代谢途径/网络重构，把原有的复杂代谢路径/网络分成单一的酶催化过程，并在整个代谢网络中分析、重组这些酶的催化过程。该过程需要收集微生物细胞所有相关的代谢信息，并把这些代谢信息汇成一个完整的数学模型。分析和研究重组代谢网络可以确定代谢过程的关键特征，例如资源分布、生长收率、必要的基因和网络的鲁棒性（robustness），这些信息有助于新生物技术的产生。同时，代谢途径/网络重构让研究者能够更深入地了解目标微生物的代谢机制。代谢途径/网络重构首先要对目标微生物的基因组和生理特性有深入的研究。对代谢途径/网络的信息了解来源于微生物的基因组序列，但是仅仅依据这些信息的途径重建过程有诸多缺陷。此外，得益于高通量实验数据，并结合蛋白质序列分析信息，基因的系统生物学便能够更好地来指导这一重组过程。同时，可视化的代谢组学数据让研究者可以更方便清晰地了解相关的生物功能。