福建航海教育由被毛泽东赞誉为"华侨旗帜,民族光辉"的陈嘉庚先生于1920年创办,是国内历史最悠久的航海类教育的高等院校。在国内和东南亚具有广泛影响力,被誉为"中国航海家的摇篮"。1952年9月,福建私立集美水产商船专科学校与厦门大学航务专修科(即现在的集美大学航海学院)合并成立"国立福建航海专科学校",时为新中国仅有的三所高等航海学校之一。1953年,福建航海专科学校与大连海运学院合并。1954年,在陈嘉庚的呼吁下,集美学村恢复航海教育,成立"厦门市私立集美水产航海学校"。1970年并入厦门大学,1973年又脱离厦门大学。1978年底,学校更名为"集美航海专科学校",1989年5月更名为"集美