肝胆管结石病也称肝内胆管结石或原发性肝胆管结石，一般特指始发于肝内胆管系统的结石，不包括胆囊排出并上移至肝内胆管的结石。也不包括继发于损伤性胆管狭窄、胆管囊肿等胆道疾病所致的肝胆管结石。是胆管结石的一种类型，是指左右肝管汇合部以上各分枝胆管内的结石。它可以单独存在，也可以与肝外胆管结石并存。一般为胆红素结石。本病常合并肝外胆管结石;并发胆管梗阻;诱发局部感染及继发胆管狭窄，使结石难以自行排出，病情迁延不愈。发病原因与胆道的细菌感染、寄生虫感染及胆汁滞留有关。此外，胆汁中的黏蛋白、酸性黏多糖、免疫球蛋白等大分子物质，炎性渗出物，脱落的上皮细胞、细菌、寄生虫、胆汁中的金属离子等，均参与结石的形成。