科恩-沈方程（Kohn-Sham equation），理学-化学-物理化学-计算与理论化学，具体对多电子体系实施密度泛函理论计算的方法。现代密度泛函方法计算通常利用科恩-沈（Kohn-Sham）方程实现。科恩-沈方法把多电子相互作用体系映射到一个无相互作用参考体系。在此基础上，应用变分原理，使得无相互作用参考体系和真实体系的化学势相等，就得到科恩-沈轨道所满足的单电子方程。然后应用自洽场迭代方法，求解科恩-沈方程，求出体系密度，并给出相应的能量。具体如下：首先定义了一个无相互作用体系，即科恩-沈体系，该体系的能量哈密顿算符写为：…（1）式中为电子动能算符；为一选定的定域外势。由于不存在电子-电子相互作用，科恩-沈体系的薛定谔方程容易求解，体系的波函数在无简并的情况下可用单斯莱特（Slater）行列式表示，即。