内源微生物（indigenous microorganisms），工学-石油与天然气工程-油气田开发工程-提高石油采收率-微生物采油-内源微生物，长期栖息于油层中以烃为唯一碳源生长的微生物，或长期注水开发的油藏地下存在的相对稳定的原地微生物生态系统。又称本源微生物。类型①烃降解菌。可以通过新陈代谢作用产生分解酶，裂解重质烃类和石蜡，降低原油黏度，从而改善原油流动性。石油烃降解菌大部分为好氧菌，即烃氧化菌。②硫酸盐还原菌。能够以硫酸盐为电子受体，以有机物和氢为电子供体。油田污水回注系统和油层缺氧环境中广泛存在硫酸盐还原菌，因其代谢产物对钢铁管线等有很强的腐蚀作用，因此在油田开采中需要利用化学或生物的方法对其严格控制。③产甲烷菌。是严格厌氧菌，广泛分布于低盐和高盐度的中温油藏中。在油藏中除上述微生物外，还有硝酸盐还原菌、铁细菌、腐生菌等。此外，还有绝大多数的未培养微生物，这些微生物菌落对石油的生产都有一定的影响。