结构描述符（structural descriptor），理学-化学-物理化学-化学信息学-定量构效关系-二维定量构效关系-结构描述符，在定量构效关系研究中，化合物的结构不能被计算机直接利用，因而在结构和活性之间建立起数学模型，把化合物的结构表示为可定量描述的变量。结构描述符可分为基于二维结构的二维（2D）描述符和基于三维结构的三维（3D）描述符。拓扑描述符是一种常用的2D描述符，它通过对表征分子图的矩阵实施某种数字运算而获得，是一种图的不变量，直接产生于分子结构，反映了化合物的结构特征。应用比较广泛的拓扑指数包括分子连接性指数、电拓扑状态指数、分子电性矩矢量及Kappa指数等。3D结构描述符是基于分子的三维结构计算得到的分子特征，包括分子表面积、溶剂可及表面积、分子体积、分子的极性表面积等。