连锁图谱（linkage map），理学-生物学-遗传学-遗传学-基因组学-比较基因组学，显示所知的基因和/或遗传标记的相对位置，由遗传重组测验结果推算出来，以基因连锁、重组交换值构建，在一条染色体上可以发生的突变座位的直线排列（基因位点的排列）的某一物种的染色体图谱。又称遗传连锁图谱。图距为厘摩（cM），1%交换值为l厘摩，约相当于1000千碱基对。连锁图谱是基因组研究中的重要组成部分，构建连锁图谱的遗传材料是分离群体，即作图群体。按其遗传稳定性可分为两大类：①非固定性分离群体或暂时性群体（F2、F3、F4、BC群体、三交群体），其最主要的特点是易于在短期内构建具充足大小的作图群体。②永久性或固定性的作图群体，滞育激素（DH）和重组自交系（RIL）为永久性的作图群体，它们克服了暂时性群体的不足之处，但构建这样的群体不是难度大，就是耗时长。随着计算机技术的发展，已有多个构建连锁图谱的软件，研究者使用较多的软件主要有MapMaker及JoinMap3.0。绘制连锁图谱的方法有很多，但是在DNA多态性技术未开发时，鉴定的连锁图很少，随着DNA多态性的开发，使得可利用的遗传标志数目迅速扩增。