北京市计算中心(生物计算事业部)举办《Perl语言基础与生物信息学应用讲习班》

2015年8月2日 8:00 至 2015年8月5日 18:00 ,北京市计算中心(生物计算事业部)在 北京·北京市计算中心·海淀区丰贤中路7号举办《Perl语言基础与生物信息学应用讲习班》。

会议通知


Perl语言作为绝大多数生物信息学工作者首选语言之一。北京市计算中心生物计算事业部针对没有任何计算机语言生物学医学农学等人员,且有从事生物信息学工作相关研究工作的需要。欢迎您报名参加!

培训特色

1、对口生物信息;    2、非严格语法,适合初学;

3、功能强大、跨平台;4、有巨大的第三方代码库CPAN

主办单位:北京市计算中心,生物计算事业部

会议日程 (最终日程以会议现场为准)


日期

时间

授课题目

授课内容

第一天

09:30-10:00

生物信息学与Perl语言概述

概括介绍生物信息学背景与Perl语言的概念及特点

10:00-10:20

软件安装与运行环境调试

Perl语言解释器、编辑器安装,Perl程序运行测试

10:20-12:00

基本操作与基本概念

DOS、Unix命令行操作基本命令;Perl语言基本变量与操作符;基本变量、字符串赋值、基本运算等

13:30-16:30

基本语法结构、文件与文件夹操作

判断结构;循环结构;文件的读入与输出;文件夹操作

第二天

09:30-12:00

数组、二维数组、hash表及应用

数组的概念及用法;

二维数组概念与应用;

关联数组(hash表)的用法;

13:30-16:30

函数、子程序、正则表达式

常用函数学习;

子程序概念与应用;

正则表达式的应用;

第三天

09:30-11:00

生物信息学Perl程序实例与应用

常用生物信息学数据库及专业软件应用简介;

二代测序数据分析;

生物信息学实用程序;

11:00-12:00

CAPN与Bioperl简介、Bioperl的安装

Perl模块安装、包与引用简介;

Perl第三方代码库CPAN的简介与应用;

Bioperl简介与安装;

13:30-16:30

Bioperl的基本应用

文件读取与格式转换;

生物学数据自动化批量下载;

序列信息统计与分析

第四天

09:30-12:00

Bioperl应用进阶学习

GenBank基因组文件特定信息提取;

序列自动化比对;

进化距离计算;

13:30-16:00

数据可视化与做图等

Perl语言做图;

基因组信息图形化展示;

Perl的外界调用与整合应用;

Perl面向对向编程序

(此表仅供参考,授课内容以实际授课为准)

会议嘉宾

即将更新,敬请期待

会议门票


收费标准

注册费:3000元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用),住宿费用自理。

报名优惠政策

1、3人以上团体报名每人可减少400元;

2、4+1团报,可免费赠送一个名额;               

3、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种;

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

北京市计算中心

介绍:北京市计算中心建立于一九七三年,是国内最早一批计算中心之一,是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构,服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来,完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、,拥有了200余项国际国内领先的技术和产品,为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献

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