中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会举办《基因组关联分析技术应用培训班》

2017年4月18日 8:00 至 2017年4月20日 18:00 ,中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北科产业3号楼 ·北京市海淀区丰贤中路7号举办《基因组关联分析技术应用培训班》。

培训介绍


基因组关联分析技术应用培训班

基因组关联分析技术应用培训班宣传图

以“共变法”思想为核心的关联分析是研究人类复杂疾病的主要手段,其与以“求同法”思想为核心的“序列比对(Blast)”同样重要,但方法学却复杂得多。北京市计算中心生物计算事业部,主要针对具备一定统计学、遗传学、分子生物学基础的人类医学领域研究人员,特开设基因组关联分析培训班。


主办单位:中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位:北京市计算中心

协办单位:云计算关键技术与应用北京市重点实验室 、中国医药生物技术学会生物医学信息技术分会 、北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心 、中国生物工程杂志 、北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

举办地点:北京,北京市海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼

培训时间:2017年4月18日-4月20日  上午9:30-12:00,下午13:30-17:30


【培训特色】

无需任何计算机语言基础

深入简出,内容精要实用

结合人类医学、动植物育种等生物学数据背景知识与实例讲授

统计学原理+模型/算法+编程实现+生物医学应用

边学边练,重实践,力求实效

小班授课,个别辅导

中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

中国生物工程学会(Chinese Society of Biotechnology,CSBT)成立于1993年,首任理事长:谈家桢院士,现任理事长:高福院士。中国生物工程学会成立以来,主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动,为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

培训日程


日期

授课题目

授课内容

第一天

基因组关联分析理论基础

  1. 基因组学与生物信息学概述;

  2. 基于群体遗传的数据获取;

  3. 基因组关联分析的原理、数模、策略及常用软件介绍;

Plink软件基础应用

  1. Plink软件应用;

  2. Plink文件格式生成与解析;

  3. 等位基因频率计算;

  4. 哈-温平衡计算;

  5. 目标区域数据提取;

  6. 基因组关联分析流程;

第二天

基因型填充Imputation

  1. 基因型填充Imputation的原理及应用;

  2. Beagle软件介绍与应用;

  3. 基因组填充的方法与分析流程;

  4. 1000G数据应用

Plink软件进阶应用

  1. 基于家系的关联分析;

  2. 曼哈顿图的绘制与结果展示;

  3. SNP位点的condition分析;

  4.  

第三天

Haploview软件

  1. Haploview软件应用;

  2. Haplotype单倍型分析;

  3. LD连锁不平衡指数计算;

  4. SNP marker之间的r2、D值等计算;

Tassel软件

  1. Tassel软件应用;

  2. Tassel基于命令行的批量数据分析;

  3. 生物多样性指数、PCA、遗传距离计算等;

  (课程内容以实际授课为准)

会议嘉宾

即将更新,敬请期待

参会指南


【报名费用】注册费:3500元/人(含听课费、资料费、上机费、午餐,请自带笔记本电脑以备上机实践使用)。

【报名优惠政策】

1、2017年3月15日前报名并缴费,可享受减免300元优惠;

2、3人以上团体报名每人可减少400元;

3、4+1团报,可免费赠送一个名额

4、上面3种优惠政策不能同时享受,只能享受其中一种。

培训以收到学员培训费为成功报名,培训座位按收到费用先后顺序安排。

北科产业3号楼

北京中关村永丰高新技术产业基地位于海淀区北清路99号。按不同的用地性质规划为4个工业生产区、一个公共服务中心和一个生活居住区。规划建筑面积386.85万平方米,规划绿地率35%,总容积率0.99。基地内科研、工业区用地207.16公顷,重点吸纳新材料产业、信息产业、生物工程与新医药产业、环保及资源综合利用产业、光机电一体化产业、空间技术产业等经济效益好、科技附加值高、技术密集的绿色环保无污染的高新技术产业。科研、工业1区位于基地西北部,用地面积82.68公顷,划分为77个地块,计划发展成为以纳米材料技术产业、超导材料技术产业、砷化镓和镁合金技术产业为主导的新材料产业园区。

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