中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会举办《实用生物信息学研讨班》

2017年8月21日 8:00 至 2017年8月25日 18:00 ，中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会在 北京·北京市计算中心·海淀区丰贤中路7号举办《实用生物信息学研讨班》。

会议介绍

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实用生物信息学研讨班宣传图

如您所知，近年来，以基因组科学为代表的研究工作和技术平台先后获得各项资助，如国家863计划、973计划、中国科学院知识创新工程、国家重大攻关项目、自然科学基金，等。为了辅助广大科研工作者掌握高通量测序技术原理、实验设计以及后期数据分析技能，北京市计算中心生物计算事业部与北京博奥晶典生物技术有限公司联合举办“实用生物信息学”研讨班。

主办单位：中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专委会

承办单位：北京市计算中心，北京博奥晶典生物技术有限公司

协办单位：云计算关键技术与应用北京市重点实验室

              医药生物技术学会生物医学信息技术分会

              北京市基因测序与功能分析工程技术研究中心

              中国生物工程杂志

              北京唐唐天下生物医学信息科技有限公司 

              军事医学科学院微生物流行病研究所生物信息学研究室

培训地点：北京海淀区丰贤中路7号北科产业3号楼，北京市计算中心三层会议室

课程时间：2017.8.21-8.25  上午：9:30-12:00下午：13:30-17:00

授课教师：来自北京市计算中心、军事医学科学院、北京博奥晶典生物技术有限公司，每个讲师都在生物信息学、基因组学领域有丰富的工作经验。

实际实用：理论讲授和上机实习搭配，结合具体案例。

中国生物工程学会（Chinese Society of Biotechnology，CSBT）成立于1993年，首任理事长：谈家桢院士，现任理事长：高福院士。中国生物工程学会成立以来，主办、承办、协办了多个国际、国内学术交流活动，为促进生物技术与生物产业发展、提高国民素质、促进经济和社会发展等方面发挥了重要作用。

会议日程 （最终日程以会议现场为准）

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日期	上课时间	授课题目	授课内容
第一天	9：30-12：00	生物信息学导论与前沿	1、生物信息背景与研究进展； 2、新一代测序技术前沿介绍； 3、10X Genomics测序技术与平台介绍；（1h）
		生物信息学数据库 及公共资源介绍	1、生物信息学数据库与公共生物信息资源与应用NCBI数据库介绍：PubMed、GenBank、Entrez等，数据查询检索；GEO、SRA数据库使用； KEGG数据库介绍；
	13：30-17：00	生物信息学基础 （上机操作）	1、linux基础： 掌握Linux系统下的常用命令 掌握linux环境下软件的安装使用 了解shell脚本的编写 2、perl基础： 介绍Perl 的基本元素 Perl在生物信息中应用示例
第二天	9：30-12：00	二代测序技术原理及 基因组拼接	1、介绍目前主流二代测序仪的测序原理； 2、主要操作流程及特点； 3、序列拼接的技术方法； 4、常用软件及全基因组个性化组装的技巧；
	13：30-17：00	基因组拼接组装 （以细菌/病毒为例） （上机操作）	1、全基因组组装的流程介绍； 2、原始测序数据的预处理； 3、分别介绍Velvet和SOAPdenovo的使用，并以一株细菌的测序数据为例进行组装； 4、介绍Newbler的使用，并以噬菌体数据为例进行组装； 5、以细菌的数据为例，介绍填补gap的方法，包括延伸法，局部拼接法；
第三天	9：30-12：00	基因组重测序与数据分析	1、讲解基因组重测序的概念、目的与应用； 2、结合实例讲解其原理、类据类型与格式、操作流程、软件等相关知识；
	13：30-17：00	基因组重测序数据分析 实例（上机操作）	1、对二代测序数据的解读； 2、数据质量控制及数据过滤； 3、使用BWA和Samtools进行数据比对并对比对结果进行可视化； 4、寻找SNP和Indel并进行注释； 5、寻找结构变异并对变异进行注释；
第四天	9：30-12：00	转录组测序与数据分析	1、转录组基本概况和研究前沿介绍：包含mRNA/miRNA/lncRNA/circRNA及全转录本和ceRNA的概念介绍； 2、转录组测序技术流程及技术细节； 3、转录组芯片主流产品介绍(1h)； 4、转录组应用案例；
	13：30-17：00	转录组数据分析实例 （上机操作）	1、转录组数据准备和软件介绍及安装； 2、转录组数据的比对； 3、表达量估计和分析； 4、后续功能分析简介；
第五天	9：30-17：00	测序和芯片数据二次分析与文章发表应用	1、利用DAVID免费在线分析工具进行基因功能分析，结果解读； 2、基于String、DIP等数据库的蛋白质相互作用分析与图形可视化； 3、利用Cytoscape 绘制生物分子交互作用复杂网络图、生物学通路的方法及技术应用； 4、利用ENCOLD、RegulomeDB对疾病突变位点进行功能性分析； 5、利用R的绘图命令绘制常见的图表（散点图、条形图、文氏图、饼图、盒形图、频率直方图及热图等的绘制）

 (课程内容以实际授课为准)

会议嘉宾

即将更新，敬请期待

参会指南

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报名种类	优惠对象	培训费
A	在校学生（需学生证）	5500元
B	工作人员	6000元
培训费含听课费、材料费、上机费。请自带笔记本电脑用以上机实习。 材料：《高通量测序与高性能计算理论和实践》北京科学技术出版社。

附近最近酒店为：如家酒店（永丰店），可自行网上预定，食宿自理。
 

【 报名优惠政策】
   1、3人以上团体报名每人可减少400元； 
   2、4+1团报，可免费赠送一个名额                
以上优惠政策不能同时享受，只能享受其中一种。
培训以收到学员培训费为成功报名，培训座位按收到费用先后顺序安排。

北京市计算中心建立于一九七三年，是国内最早一批计算中心之一，是中国最早、最具影响力的从事计算机应用技术研究及推广的机构，服务对象则涉及工业、商业、交通、能源、环保金融、税务、社会事务等多个领域。北京市计算中心自成立以来，完成了上百项国家和北京市政府有关部门委托的研究项目和面向多种用户的服务型项目。先后获得国家及省部级成果奖30多项、，拥有了200余项国际国内领先的技术和产品，为中国计算机的普及、应用和发展做出了杰出贡献